大型發(fā)酵罐液體菌種替代固體菌種已經(jīng)是大勢所趨，現(xiàn)在越來越多的工廠開始使用液體菌種進行生產(chǎn)，雖然液體菌種各項生產(chǎn)指標都優(yōu)于固體菌種，但是液體菌種容易染菌的特性是各大工廠頭疼的事情。
液體菌種接種前一定要經(jīng)過嚴格的檢測才能夠使用，但是更重要的是一旦發(fā)酵罐出現(xiàn)染菌，一定要盡快分析出染菌的原因，并加以解決。要分析發(fā)酵罐染菌的原因，我們首先得了解每一環(huán)節(jié)出現(xiàn)染菌的現(xiàn)象是什么，當出現(xiàn)染菌時，我們就能知道是哪個環(huán)節(jié)出問題了。
一、大型發(fā)酵罐滅菌
大型發(fā)酵罐滅菌不徹底引起的染菌會在2-3天內(nèi)表現(xiàn)出來，其表現(xiàn)是培養(yǎng)液逐漸變得渾濁，菌球形成和生長變慢，不同細菌從排氣味道上表現(xiàn)的程度有所不同，必須要注意的是如果培養(yǎng)的是低溫品種，如金針菇，有表現(xiàn)的時間會延后，甚至到接種前從宏觀上也沒有明顯的表現(xiàn)，只有通過檢測才能確定已經(jīng)感染細菌了。
引起發(fā)酵罐滅菌不徹底的原因主要是在滅菌鍋發(fā)生的，而單體罐只要在滅菌過程的操作上。
解決辦法：滅菌鍋發(fā)酵罐，檢查滅菌鍋程序、管路、電磁閥（氣動閥）、溫度傳感器、壓力傳感器等。單體發(fā)酵罐，檢查冷空氣是否排凈、管路滅菌是否達標等。經(jīng)過排查還不能解決，就需要適當增加滅菌時間或者滅菌溫度。
二、大型發(fā)酵罐冷卻
冷卻過程引起染菌主要是因為冷卻過程到壓力"0"以前沒有及時給發(fā)酵罐進氣，造成負壓，雖然管路都安裝有單向閥，但是要知道單向閥不是的，而且單向閥使用時間久了出現(xiàn)故障的可能性很高。一般因為冷卻引起的染菌幾率不高，染菌表現(xiàn)出來的時間比滅菌不徹底引起的染菌要晚一些。
解決辦法：發(fā)酵罐冷卻時安排專人負責，避免出現(xiàn)負壓的情況，加強發(fā)酵罐管件的日常檢查維護。
三、大型發(fā)酵罐氣源
氣源引起發(fā)酵罐染菌表現(xiàn)出來的時期不確定，沒有規(guī)律，同時氣源帶菌的輕重對染菌表現(xiàn)也有輕重之分。特別是氣源進水引起的影響，氣源引起染菌有一個特點是不同天數(shù)的發(fā)酵罐同時表現(xiàn)染菌。
解決辦法：每天或者定期對無菌空氣質(zhì)量進行檢測，加強無菌空氣系統(tǒng)設(shè)備的巡檢工作。氣源長時間中斷也會對液體菌種生長造成影響，但一般不會引起染菌。
四、大型發(fā)酵罐接種
大型發(fā)酵罐接種的過程是罐體開放與外界連通的過程，是危險的環(huán)節(jié)，接種引起的染菌表現(xiàn)嚴重時會很快，在1-2天就有可能表現(xiàn)出來，主要是人員操作不當所引起，食用菌層流罩凈化效果下降也會引起染菌。
解決辦法：加強接種人員的操作技能，要制定出操作規(guī)程；定期檢查接種層流罩的凈化效果，必要時每天對層流罩進行平板沉降檢測。
五、大型發(fā)酵罐三角瓶菌種
三角瓶菌種不純會直接導(dǎo)致發(fā)酵罐染菌，表現(xiàn)的時期也很早，快天就會出現(xiàn)劇烈的表現(xiàn)，這種情況出現(xiàn)的幾率不是很大，但是也要對三角瓶菌種的純度給予足夠的重視，一個合格的液體菌種技術(shù)員不單是發(fā)酵罐做的好，制作試管母種和三角瓶的水平也很重要。
解決辦法：重視和加強試管母種、三角瓶菌種制作水平，做好標準，并且要執(zhí)行，如果對三角瓶菌種沒有把握，可以將接種后的三角瓶進行空培養(yǎng)。
另外，發(fā)酵的系統(tǒng)設(shè)備不合理也會染菌，例如蒸汽系統(tǒng)、無菌空氣系統(tǒng)、物料消毒系統(tǒng)、冷水系統(tǒng)等。蒸汽的溫度高低、壓力大小、蒸汽中含冷凝水量會影響蒸汽的質(zhì)量，由于濕飽和蒸汽中冷凝水含量大，蒸汽溫度低、壓力波動大，可能造成滅菌溫度時間達不到雜菌的致死時間和致死溫度而造成發(fā)酵染菌。
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