SDS聚丙烯酰胺凝膠染色是蛋白質研究的一個基礎方法。染色方法有很多，實際應用中，考馬斯亮藍染色（考染）和銀染是運用的多的方法。
考馬斯亮藍G250在游離狀態(tài)下呈紅色，它與蛋白質結合后變?yōu)樗{色，結合物在595 nm波長下有光吸收。其光吸收值與蛋白質含量成正比，因此可用于蛋白質的定量測定。
銀染實驗中，在堿性條件下，銀離子被還原成金屬銀，沉淀在蛋白質的表面上顯色。蛋白電泳后的 SDS-聚丙烯酰胺凝膠在甲醇溶液中浸泡后，水洗后用硝酸銀溶液銀染，再水洗后用碳酸鈉甲醇水溶液顯色。
與考染相比，銀染具有靈敏度高的優(yōu)點，很多做環(huán)境、植物、育種等方面的客戶，都會做銀染方面的實驗。銀染對于試劑的要求比較高，尤其對其中使用純水的水質要求比較高。上海樂楓（RephiLe）技術人員根據(jù)自身經驗以及相關文獻中的方法為用戶提出以下銀染實驗方案：
一、儀器和試劑
乙酸（1%），顯影液（2.5%碳酸鈉和0.02%甲醛水溶液），乙醇（30%），固定液（乙醇:冰醋酸:水（30:10:60）），硝酸銀溶液（0.1%），顯影液（將溶液A在850 mL去離子水中加入37 g NaCl和37 g CuSO4，再加入濃氨水直到深藍色沉淀形成然后溶解，定容至1 L）和溶液B（在900 mL去離子水中加入436 g 硫代硫酸鈉，定容至1 L）混合，加三倍水稀釋，立即使用
二、試驗方法
1. 通過SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳分離蛋白質；
2. 將凝膠浸泡在至少5倍體積的固定液中，室溫下平緩搖動4 - 12 h，使蛋白固定；
3. 棄去固定液，加至少5倍體積的30%乙醇，室溫下平緩搖動30 min；
4. 重復步驟3；
5. 棄去乙醇，加10倍體積的純水（去離子水），室溫下平緩搖動10 min；
6. 重復步驟5兩次；
7. 棄去清洗用水，加5倍體積的硝酸銀溶液，室溫下平緩搖動30 min；
8. 棄去硝酸銀溶液，用純水（去離子水）漂洗凝膠兩面，每面20 s；
9. 加5倍體積的新鮮顯影液，室溫下平緩搖動，數(shù)分鐘內出現(xiàn)蛋白質的染色條帶，繼續(xù)至條帶清晰；
10. 用1%乙酸清洗凝膠終止反應，再用純水（去離子水）水漂洗數(shù)次，每次10 min。
銀染后的凝膠可以通過凝膠成像系統(tǒng)或掃描儀轉化為照片，或者可以直接用手機拍攝。
在銀染實驗中，純水（去離子水）水質非常重要，對實驗成功與否起著關鍵性的作用。有用戶在實驗中忽略了這一點，純水水質不佳，導致氯離子含量超標，浸泡時出現(xiàn)硝酸銀沉淀，沉淀在膠上，顯影的時候看到的是一片花花的亂象，影響了染色效果。
氯化銀的溶解度通常是2 ppm，氯離子是水中常見的一種離子雜質，如果水中的氯離子超過2 ppm，即有可能出現(xiàn)雜質，也就是說，對于銀染實驗，對于純水質量的要求還是比較苛刻的，一般的反滲透純水（RO）設備，還難以達到要求。
另外，水中的顆粒物也會吸附銀離子沉淀顯色，污染背景，甚至讓好好的凝膠成了“大花臉”。因此制備出來的純水在使用前，還應該通過0.22或0.45μm的過濾器預先過濾，以去除水中的顆粒物。
專業(yè)來講，銀染用水應該盡量選用符合國標《分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法》（GB/T 6682-2008）（參考鏈接 http://rephile.com.cn/web/news-1686465.html）二級純水以上的水——電導率至少應當在 1 μS/cm以下。因此，銀染用水應當使用EDI純水或者超純水，而RO 純水是不能滿足銀染用水需求。
國內做實驗室EDI純水設備的廠家很少。樂楓是國內早生產EDI實驗室純水設備的供應商。樂楓新一代 Genie G 智能型一體化超純水系統(tǒng)可以同時制備EDI 純水和超純水。Genie G 生產的 EDI 純水水質完全滿足銀染實驗，還可以用來配制其他相關實驗的試劑；超純水可以應用于銀染實驗的上下游以及其他蛋白質研究實驗，例如蛋白SDS-PAGE電泳、Western Blotting等。取水終端安裝的RephiBio濾器，可以制備無熱原（內毒素）、核酸酶、細菌的超純水，用于生化分析和分子生物學。Genie G一機兩水，高度集成，可以充分滿足高端生命科學實驗室整體用水的需求，質量不輸進口設備，用戶使用起來，完全可以“用水無憂”。
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