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公司基本資料信息
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1、客戶端版必須與國家中央服務(wù)軟件(國家食品安全風(fēng)險評估中心TraNetChina)相匹配,是國家、省級和地級食源性疾病監(jiān)測分析與研究溯源的軟件。它可以將基層疾控機構(gòu)采集的致病微生物基因圖譜數(shù)據(jù)進行數(shù)據(jù)管理、數(shù)據(jù)分析和數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)共享。
2、中文版本,中文界面和操作提示,同時支持中英文雙界面切換,方便業(yè)內(nèi)技術(shù)人員準確、快捷地對食源性疾病數(shù)據(jù)進行比較篩查、分析研究、監(jiān)測溯源。
3、指紋數(shù)據(jù)模塊(Fingerprint Data Module):處理電泳數(shù)據(jù)(包括凝膠電泳和毛細管電泳)、色譜數(shù)據(jù)、光譜數(shù)據(jù)等。
4、特征數(shù)據(jù)模塊(Character Data Module):處理特征字符數(shù)據(jù)包括抗生素敏感性實驗數(shù)據(jù)、脂肪酸數(shù)據(jù)、微陣列芯片數(shù)據(jù)、酶活測試(API®, Biolog®, Vitek®)和代謝活性數(shù)據(jù)等。
5、序列數(shù)據(jù)模塊(Sequence Data Module):支持核酸和氨基酸序列的導(dǎo)入及分析,包括Sanger測序和二代測序數(shù)據(jù)(NGS),支持embl, gb, fasta等序列格式。具備多序列比對、進化樹分析、染色體序列比對分析、序列信息注釋、SNP分析、PCR引物設(shè)計、限制性內(nèi)切酶酶切位點分析、開放閱讀框自動查找等功能。
6、樹狀分析和網(wǎng)絡(luò)推理模塊(Tree and Network Inference module):能對關(guān)系數(shù)據(jù)庫中的多種實驗數(shù)據(jù)進行聚類分析。
7、ID分析模塊(Classifiers and Identification module):即利用監(jiān)督式學(xué)習(xí)對數(shù)據(jù)進行分類、數(shù)據(jù)庫篩選、決策網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和菌種分類鑒定等。
8、基因組分析工具(Genome Analysis Tools Module):基因組分析工具模塊提供基因組和染色體比對分析、基因注釋、wgMLST、wgSNP分析等功能。支持自定義二級分析框架(如cMLST、rMLST等)的構(gòu)建。配合BioNumerics的表型分析插件,用戶還同時可以獲取分離菌的血清型、病毒性和耐藥性等數(shù)據(jù)。
9、耐藥分析插件(Antibiotics susceptibility plugin):可以收集、上報導(dǎo)入耐藥分析結(jié)果。
10、TraNetChina數(shù)據(jù)上報和審核插件:接入國家食源性疾病分子溯源網(wǎng)絡(luò)(TraNetChina),各市級疾控中心或其他技術(shù)機構(gòu)可與省級平臺對接進行數(shù)據(jù)上報和比對分析;省級疾控中心管理員可以審核和管理全省數(shù)據(jù),并可以將全省信息上報國家食品安全風(fēng)險評估中心。
11、TraNetChinaCRS插件:無縫連接國家食源性疾病檢測報告系統(tǒng),獲取國家食源性疾病監(jiān)測報告系統(tǒng)中相關(guān)病例及標本信息。
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