無公害食品標準主要包括無公害食品行業(yè)標準和農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量國家標準，二者同時頒布。無公害食品行業(yè)標準由農(nóng)業(yè)部制定，是無公害農(nóng)產(chǎn)品認證的主要依據(jù)；農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量國家標準由國家質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督檢驗檢疫總局制定。
一、無公害食品行業(yè)標準
建立和完善無公害食品標準體系，是全面推進“無公害食品行動計劃”的重要內(nèi)容，也是開展無公害食品開發(fā)、管理工作的前提條件。農(nóng)業(yè)部2001年制定、發(fā)布了73項無公害食品標準，2002年制定了126項、修訂了11項無公害食品標準，2004年又制定了112項無公害標準。無公害食品標準內(nèi)容包括產(chǎn)地環(huán)境標準、產(chǎn)品質(zhì)量標準、生產(chǎn)技術(shù)規(guī)范和檢驗檢測方法等，標準涉及120多個（類）農(nóng)產(chǎn)品品種，大多數(shù)為蔬菜、水果、茶葉、肉、蛋、奶、魚等關(guān)系城鄉(xiāng)居民日常生活的“菜籃子”產(chǎn)品。
無公害食品標準以全程質(zhì)量控制為核心,主要包括產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量標準、生產(chǎn)技術(shù)標準和產(chǎn)品標準三個方面，無公害食品標準主要參考綠色食品標準的框架而制定。
1. 無公害食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量標準
無公害食品的生產(chǎn)首先受地域環(huán)境質(zhì)量的制約，即只有在生態(tài)環(huán)境良好的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)區(qū)域內(nèi)才能生產(chǎn)出優(yōu)質(zhì)、安全的無公害食品。因此，無公害食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量標準對產(chǎn)地的空氣、農(nóng)田灌溉水質(zhì)、漁業(yè)水質(zhì)、畜禽養(yǎng)殖用水和土壤等的各項指標以及濃度限值做出規(guī)定，一是強調(diào)無公害食品必須產(chǎn)自良好的生態(tài)環(huán)境地域，以保證無公害食品最終產(chǎn)品的無污染、安全性，二是促進對無公害食品產(chǎn)地環(huán)境的保護和改善。
無公害食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量標準與綠色食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量標準的主要區(qū)別是：無公害食品同一類產(chǎn)品不同品種制定了不同的環(huán)境標準，而這些環(huán)境標準之間沒有或有很小的差異，其指標主要參考了綠色食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量標準；綠色食品是同一類產(chǎn)品制定一個通用的環(huán)境標準，可操作性更強。
2. 無公害食品生產(chǎn)技術(shù)標準
無公害食品生產(chǎn)過程的控制是無公害食品質(zhì)量控制的關(guān)鍵環(huán)節(jié)，無公害食品生產(chǎn)技術(shù)操作規(guī)程按作物種類、畜禽種類等和不同農(nóng)業(yè)區(qū)域的生產(chǎn)特性分別制訂的，用于指導無公害食品生產(chǎn)活動，規(guī)范無公害食品生產(chǎn)，包括農(nóng)產(chǎn)品種植、畜禽飼養(yǎng)、水產(chǎn)養(yǎng)殖和食品加工等技術(shù)操作規(guī)程。
從事無公害農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)的單位或者個人，應(yīng)當嚴格按規(guī)定使用農(nóng)業(yè)投入品。禁止使用國家禁用、淘汰的農(nóng)業(yè)投入品。
無公害食品生產(chǎn)技術(shù)標準與綠色食品生產(chǎn)技術(shù)標準的主要區(qū)別是：無公害食品生產(chǎn)技術(shù)標準主要是無公害食品生產(chǎn)技術(shù)規(guī)程標準，只有部分產(chǎn)品有生產(chǎn)資料使用準則，其生產(chǎn)技術(shù)規(guī)程標準在產(chǎn)品認證時僅供參考，由于無公害食品的廣泛性決定了無公害食品生產(chǎn)技術(shù)標準無法堅持到位。綠色食品生產(chǎn)技術(shù)標準包括了綠色食品生產(chǎn)資料使用準則和綠色食品生產(chǎn)技術(shù)規(guī)程兩部分，這是綠色食品的核心標準，綠色食品認證和管理重點堅持綠色食品生產(chǎn)技術(shù)標準到位，也只有綠色食品生產(chǎn)技術(shù)標準到位才能真正保證綠色食品質(zhì)量。
3. 無公害食品產(chǎn)品標準
無公害食品產(chǎn)品標準是衡量無公害食品終產(chǎn)品質(zhì)量的指標尺度。它雖然跟普通食品的國家標準一樣，規(guī)定了食品的外觀品質(zhì)和衛(wèi)生品質(zhì)等內(nèi)容，但其衛(wèi)生指標不高于國家標準，重點突出了安全指標，安全指標的制訂與當前生產(chǎn)實際緊密結(jié)合。無公害食品產(chǎn)品標準反映了無公害食品生產(chǎn)、管理和控制的水平，突出了無公害食品無污染、食用安全的特性。
無公害食品產(chǎn)品標準與綠色食品產(chǎn)品標準的主要區(qū)別是：二者衛(wèi)生指標差異很大，綠色食品產(chǎn)品衛(wèi)生指標明顯嚴于無公害食品產(chǎn)品衛(wèi)生指標。以黃瓜為例：無公害食品黃瓜衛(wèi)生指標11項，綠色食品黃瓜衛(wèi)生指標18項；無公害食品黃瓜衛(wèi)生要求敵敵畏≤0.2 mg/kg，綠色食品黃瓜衛(wèi)生要求敵敵畏≤0.1 mg/kg。另外，綠色食品蔬菜還規(guī)定了感官和營養(yǎng)指標的具體要求，而無公害蔬菜沒有。綠色食品有包裝通用準則，無公害食品沒有。
按照國家法律法規(guī)規(guī)定和食品對人體健康、環(huán)境影響的程度，無公害食品的產(chǎn)品標準和產(chǎn)地環(huán)境標準為強制性標準，生產(chǎn)技術(shù)規(guī)范為推薦性標準。
二、農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量國家標準
為提高蔬菜、水果的食用安全性，保證產(chǎn)品的質(zhì)量，保護人體健康，發(fā)展無公害農(nóng)產(chǎn)品，促進農(nóng)業(yè)和農(nóng)村經(jīng)濟可持續(xù)發(fā)展，國家質(zhì)量監(jiān)督檢驗檢疫總局特制定農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量GB18406和GB/T18407，以提供無公害農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)地環(huán)境和產(chǎn)品質(zhì)量國家標準。農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量分為兩部分，無公害農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)地環(huán)境要求和無公害農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)品安全要求。
（一）無公害農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)地環(huán)境要求
《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量》產(chǎn)地環(huán)境要求GB/T18407-2001分為以下四個部分：
1. 《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量 無公害蔬菜產(chǎn)地環(huán)境要求》（GB/T18407.1-2001）
該標準對影響無公害蔬菜生產(chǎn)的水、空氣、土壤等環(huán)境條件按照現(xiàn)行國家標準的有關(guān)要求，結(jié)合無公害蔬菜生產(chǎn)的實際做出了規(guī)定，為無公害蔬菜產(chǎn)地的選擇提供了環(huán)境質(zhì)量依據(jù)。
2. 《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量 無公害水果產(chǎn)地環(huán)境要求》（GB/T18407.2-2001）
該標準對影響無公害水果生產(chǎn)的水、空氣、土壤等環(huán)境條件按照現(xiàn)行國家標準的有關(guān)要求，結(jié)合無公害水果生產(chǎn)的實際做出了規(guī)定，為無公害水果產(chǎn)地的選擇提供了環(huán)境質(zhì)量依據(jù)。
3. 《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量 無公害畜禽肉產(chǎn)地環(huán)境要求》（GB/T18407.3-2001）
該標準對影響畜禽生產(chǎn)的養(yǎng)殖場、屠宰和畜禽類產(chǎn)品加工廠的選址和設(shè)施，生產(chǎn)的畜禽飲用水、環(huán)境空氣質(zhì)量、畜禽場空氣環(huán)境質(zhì)量及加工廠水質(zhì)指標及相應(yīng)的試驗方法，防疫制度及消毒措施按照現(xiàn)行標準的有關(guān)要求，結(jié)合無公害畜禽生產(chǎn)的實際做出了規(guī)定。從而促進我國畜禽產(chǎn)品質(zhì)量的提高，加強產(chǎn)品安全質(zhì)量管理，規(guī)范市場，促進農(nóng)產(chǎn)品貿(mào)易的發(fā)展，保障人民身體健康，維護生產(chǎn)者、經(jīng)營者和消費者的合法權(quán)益。#p#分頁標題#e#
4. 《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量 無公害水產(chǎn)品產(chǎn)地環(huán)境要求》（GB/T18407.4-2001）
該標準對影響水產(chǎn)品生產(chǎn)的養(yǎng)殖場、水質(zhì)和底質(zhì)的指標及相應(yīng)的試驗方法按照現(xiàn)行標準的有關(guān)要求，結(jié)合無公水產(chǎn)品生產(chǎn)的實際做出了規(guī)定。從而規(guī)范我國無公害水產(chǎn)品的生產(chǎn)環(huán)境，保證無公害水產(chǎn)品正常的生長和水產(chǎn)品的安全質(zhì)量，促進我國無公害水產(chǎn)品生產(chǎn)。
（二）無公害農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)品安全要求
《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量》產(chǎn)品安全要求GB18406-2001分為以下四個部分：
1. 《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量 無公害蔬菜安全要求》（GB18406.1-2001）
本標準對無公害蔬菜中重金屬、硝酸鹽、亞硝酸鹽和農(nóng)藥殘留給出了限量要求和試驗方法，這些限量要求和試驗方法采用了現(xiàn)行的國家標準，同時也對各地開展農(nóng)藥殘留監(jiān)督管理而開發(fā)的農(nóng)藥殘留量簡易測定給出了方法原理，旨在推動農(nóng)藥殘留簡易測定法的探索與完善。
2. 《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量 無公害水果安全要求》（GB18406.2-2001）
本標準對無公害水果中重金屬、硝酸鹽、亞硝酸鹽和農(nóng)藥殘留給出了限量要求和試驗方法，這些限量要求和試驗方法采用了現(xiàn)行的國家標準。
3. 《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量 無公害畜禽肉安全要求》（GB18406.3-2001）
本標準對無公害畜禽肉產(chǎn)品中重金屬、亞硝酸鹽、農(nóng)藥和獸藥殘留給出了限量要求和試驗方法，并對畜禽肉產(chǎn)品微生物指標對給出了要求，這些有毒有害物質(zhì)限量要求、微生物指標和試驗方法采用了現(xiàn)行的國家標準和相關(guān)的行業(yè)標準。
4. 《農(nóng)產(chǎn)品安全質(zhì)量 無公害水產(chǎn)品安全要求》（GB18406.4-2001）
本標準對無公害水產(chǎn)品中的感官、鮮度及微生物指標做了要求，并給出了相應(yīng)的試驗方法，這些要求和試驗方法采用了現(xiàn)行的國家標準和關(guān)的行業(yè)標準。
