近日，中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所觀賞漁業(yè)研究室在珠江土著魚類斑鳠基因資源研究方面取得新進(jìn)展，獲得了斑鳠雌雄端粒到端?；蚪M，為進(jìn)一步開展其繁育和雌雄鑒定研究提供了基因資源。相關(guān)研究論文“Gap-free chromosome-level genomes of male and female spotted longbarbel catfishHemibagrus guttatus”發(fā)表于國(guó)際著名期刊《Scientific Data》（JCR1區(qū)，IF2022=9.8）。該論文得到廣東農(nóng)技服務(wù)輕騎兵重大農(nóng)業(yè)技術(shù)鄉(xiāng)村行推廣項(xiàng)目現(xiàn)代漁業(yè)示范窗口子項(xiàng)目（ZDGZ22-Q08029）、2022年省級(jí)鄉(xiāng)村振興戰(zhàn)略專項(xiàng)（2022SBH00001）和國(guó)家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫(kù)（FGRC18537）等項(xiàng)目資助。珠江所為第一完成單位，廣東省農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣中心、廣東漢漁生態(tài)科技有限公司和深圳大學(xué)共同參與此項(xiàng)工作。楊葉欣、劉奕和陳方燦為第一作者，牟希東研究員和卞超副研究員為共同通訊。
斑鳠，俗稱芝麻魽、白須魽，是珠江四鮮之一。因其肉質(zhì)鮮美、無(wú)肌間骨等特征，素稱淡水之王，是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)魚類。由于過(guò)度捕撈和水壩建設(shè)，中國(guó)南方的斑鳠數(shù)量急劇減少，其野生種群被列為國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生動(dòng)物（二級(jí)）。為加快斑鳠人工繁育和解決早期雌雄鑒別等產(chǎn)業(yè)問(wèn)題，該研究結(jié)合HiFi、Hi-C 和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，分別獲得了斑鳠雄性和雌性的端粒到端?；蚪M。雄性基因組大小約為749.1 Mb,BUSCO評(píng)估的完整性為94.2%；雌性基因組大小約為747.8 Mb，BUSCO評(píng)估的完整性為95.0%。雄性和雌性個(gè)體中分別獲得了35,277和34,571個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因集。本研究中組裝的兩個(gè)基因組將為后續(xù)斑鳠的種群遺傳學(xué)、繁育及性別鑒定分子標(biāo)記的開發(fā)提供數(shù)據(jù)資源。
全文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41597-024-03424-8
日期：2024-06-09
斑鳠，俗稱芝麻魽、白須魽，是珠江四鮮之一。因其肉質(zhì)鮮美、無(wú)肌間骨等特征，素稱淡水之王，是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)魚類。由于過(guò)度捕撈和水壩建設(shè)，中國(guó)南方的斑鳠數(shù)量急劇減少，其野生種群被列為國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生動(dòng)物（二級(jí)）。為加快斑鳠人工繁育和解決早期雌雄鑒別等產(chǎn)業(yè)問(wèn)題，該研究結(jié)合HiFi、Hi-C 和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，分別獲得了斑鳠雄性和雌性的端粒到端?；蚪M。雄性基因組大小約為749.1 Mb,BUSCO評(píng)估的完整性為94.2%；雌性基因組大小約為747.8 Mb，BUSCO評(píng)估的完整性為95.0%。雄性和雌性個(gè)體中分別獲得了35,277和34,571個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因集。本研究中組裝的兩個(gè)基因組將為后續(xù)斑鳠的種群遺傳學(xué)、繁育及性別鑒定分子標(biāo)記的開發(fā)提供數(shù)據(jù)資源。
全文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41597-024-03424-8
日期：2024-06-09
