1.進(jìn)樣口污染
這是較為常見(jiàn)的原因，樣品當(dāng)中的高沸點(diǎn)污染物，由于在現(xiàn)有氣相色譜條件下無(wú)法汽化，且隨著進(jìn)樣次數(shù)的增加，在進(jìn)樣口中逐漸累積，導(dǎo)致進(jìn)樣口受到污染。這種污染不僅會(huì)增加本底噪音，而且由于污染物可能與樣品當(dāng)中部分高活性目標(biāo)化合物相互作用，而導(dǎo)致該化合物峰形變差或者峰面積變小。所以去活的襯管和玻璃棉很重要。用洗液清洗襯管，雖然可以把以前的雜質(zhì)都清洗干凈，但在強(qiáng)酸條件下，硅羥基重新暴露在系統(tǒng)中，使得峰形變差甚至有丟峰的現(xiàn)象。因此，在內(nèi)襯管污染嚴(yán)重的情況下，不建議清洗襯管重復(fù)使用。
針對(duì)樣品可能帶來(lái)的污染，在實(shí)際操作中，可以考慮采用以下兩點(diǎn)措施以減小污染程度：第一，定期更換進(jìn)樣口襯管，更換的頻率主要是根據(jù)樣品的潔凈度及實(shí)際操作的結(jié)果來(lái)判定。
第二，一般來(lái)說(shuō)采用分流模式進(jìn)樣可以延長(zhǎng)襯管和色譜柱的壽命，對(duì)于靈敏度本身已滿足要求的的分析尤為合適。
需要注意：如果分流比較小，這時(shí)總流量太小，需要使用省氣模式，并把省氣模式的流量設(shè)大一些。這樣的目的是使得進(jìn)樣結(jié)束以后有足夠大的氣流吹掃進(jìn)樣口襯管，減少污染。
2.色譜柱污染
機(jī)理跟進(jìn)樣口污染類似，這種情況下不能盲目老化色譜柱。
首先要看污染物的揮發(fā)性，如果是半揮發(fā)物質(zhì)，則建議在色譜柱的最高使用溫度上限進(jìn)行一定時(shí)間的老化。
如果是不揮發(fā)的污染物，例如：葉綠素，蛋白質(zhì)，無(wú)機(jī)鹽，糖類，聚合物等等，此時(shí)老化色譜柱則起不到任何的作用，建議在排除進(jìn)樣口等因素后，從進(jìn)樣口端將色譜柱截掉0.5m左右，然后進(jìn)樣考察峰形及峰面積重現(xiàn)性。如果截掉較長(zhǎng)的柱子仍然不能解決問(wèn)題，此時(shí)則需要考慮更換色譜柱。對(duì)于分析PBDE，農(nóng)藥殘留等較臟樣品，一般約1000個(gè)樣品以后需要更換色譜柱。同時(shí)強(qiáng)烈建議用戶盡可能處理好樣品，減少不揮發(fā)污染物進(jìn)入系統(tǒng)，如果實(shí)在無(wú)法對(duì)樣品進(jìn)行進(jìn)一步的處理，可以考慮在分析柱前接一段保護(hù)柱或者直接使用guard保護(hù)分析一體柱，以減少對(duì)分析柱的污染而延長(zhǎng)其使用壽命。
3.進(jìn)樣口漏氣是另一常見(jiàn)的原因。
進(jìn)樣口微漏不容易覺(jué)察到。正確安裝及定期更換進(jìn)樣口隔墊可以最大限度避免漏氣的發(fā)生。大的漏氣會(huì)導(dǎo)致壓力不穩(wěn)，儀器報(bào)警，保留時(shí)間漂移。
有一點(diǎn)要注意的是，當(dāng)進(jìn)樣口總流量足夠大的時(shí)候，即便有微漏，在調(diào)諧報(bào)告上也看不到空氣峰。所以不能依據(jù)調(diào)諧報(bào)告來(lái)判斷進(jìn)樣口漏氣。
4.組分歧視
有些組分重現(xiàn)性不錯(cuò)，但高沸點(diǎn)或者活性高的組分重現(xiàn)性差，原因有兩個(gè)：其一跟進(jìn)樣口或者柱子的吸附有關(guān)，在第1，第2點(diǎn)已有所述；另外的原因跟襯管的結(jié)構(gòu)有關(guān)。自動(dòng)進(jìn)樣針的針長(zhǎng)40mm，是接觸不到襯管底部的，樣品被推出時(shí)掛在針尖汽化，低沸點(diǎn)的組分可以比較完全的轉(zhuǎn)移到襯管中，但高沸點(diǎn)組 分有可能隨針的提起而被帶走。
使用分流襯管，可以較好的解決這個(gè)問(wèn)題。如果使用中部填有玻璃棉的襯管，進(jìn)樣時(shí)樣品注射到玻璃棉上，傳輸效果較好，組分歧視有改善。其實(shí)對(duì)于沸點(diǎn)范圍很廣的樣品，最好的進(jìn)樣方式是冷柱頭進(jìn)樣，但這種進(jìn)樣方式對(duì)柱子的污染更加嚴(yán)重，一般用于汽柴油等潔凈的樣品。
5.質(zhì)譜傳輸線或者離子源的原因。
通常是溫度不夠，導(dǎo)致樣品有冷凝或者吸附。提高傳輸線及離子源溫度，使用高溫惰性的離子源會(huì)有所幫助。
MSD漏氣或者熱平衡不夠。這點(diǎn)從調(diào)諧報(bào)告就可以判斷出來(lái)。真空不好的MSD大質(zhì)荷比（m/z）離子的響應(yīng)會(huì)下降。通常漏氣都發(fā)生在傳輸線接口處，常見(jiàn)于換過(guò)柱子以后。
需要注意的是：石墨壓環(huán)材料熱脹冷縮明顯，有時(shí)你會(huì)看到爐溫升高的時(shí)候不漏氣，但一降溫就漏氣。尤其是在程序升溫的終溫較高時(shí)發(fā)生。為緩解這種情況，可以事先將墊圈放在爐箱內(nèi)高溫烘烤一定的時(shí)間。
6.柱子安裝不合適。
曾發(fā)現(xiàn)柱子末端從傳輸線伸出太多而導(dǎo)致重現(xiàn)性不好。如果伸出太多的話，調(diào)諧都無(wú)法通過(guò)，這時(shí)電子束打在柱子上，會(huì)得到一些奇怪的峰。色譜柱從傳輸線伸出的長(zhǎng)度基本上伸出1-2mm。進(jìn)樣口端色譜柱的長(zhǎng)短也很重要，安裝時(shí)要按照要求操作。
色譜柱選擇或者分析方法參數(shù)設(shè)置不合理，導(dǎo)致譜峰峰型差，拖尾等， 這些都會(huì)影響譜峰的積分結(jié)果，也就造成了重現(xiàn)性差。
7.流量控制不穩(wěn)。
這種原因不常見(jiàn)，而且對(duì)不分流進(jìn)樣影響不大，因?yàn)椴环至鬟M(jìn)樣是壓力控制。所以如果原先是分流進(jìn)樣，重現(xiàn)性不好，可以改成不分流模式試試，如果結(jié)果有明顯改善，那就跟流量傳感有關(guān)。
